awsの構成的にはESXiの構成より既存物理データセンタの構成をとる必要があるということでしょうか。

aws各サービスを利用して、どのような構成を行うかはお客様の設計次第となります。
また、現時点でVMWare ESXiを利用し仮想環境を構築している場合、CloudFormation等のサービスを利用してAWS上で同様の構成を行う(変換する)ことも可能です。